I. Gabinete do Secretário – GABS.;
II. Assessoria Técnica – ASTEC.;
III. Assessoria de Controle Interno – ACI.;
IV. Assessoria de Comunicação – ASCOM.;
V. Núcleo Setorial de Assuntos Jurídicos – NSAJ.;
VI. Núcleo Setorial de Planejamento Estratégico – NUSPE.;
VII. Coordenadoria de Educação Ambiental e Desenvolvimento Comunitário – CEADC;
VIII. Diretoria Geral – DG.;
IX. Departamento de Controle Ambiental – DCA.;
a. Divisão de Monitoramento e Fiscalização – DMF
b. Divisão de Cadastro e Licenciamento – DCL
c. Divisão de Laboratório – DILAB
X. Departamento de Áreas Verdes Públicas – DAVP
a. Divisão de Arborização de Logradouros Públicos – DALP
b. Divisão de Manutenção de Áreas Verdes Públicas – DMAVP
c. Divisão de Produção de Mudas – DPM
XI. Departamento de Projetos e Obras – DEPO;
a. Divisão de Elaboração de Projetos – DEP
b. Divisão de Orçamento e Acompanhamento – DOA
XII. Departamento de Gestão de Áreas Especiais – DGAE;
a. Bosque Rodrigues Alves – BRA
b. Divisão de Estudos de Áreas Especiais – DAE;
c. Divisão de Unidades de Conservação – DUC;
XIII. Departamento Administrativo e Financeiro – DAF;
a. Divisão de Contabilidade e Finanças – DCF
b. Divisão de Recursos Humanos – DRH
c. Divisão de Materiais e Serviços Gerais – DMSG
d. Assessoria de Tecnologia da Informação – ATI
e. Comissão Permanente de Licitação – CPL